本系自民國54年本校創建之始即已設立，初期以五專及二專學制為主，強調商業及會計之基礎訓練。自89年本校改制為技術學院，本系於90學年度開始招收二技及四技學生，92年本系改名為「會計資訊系」後，以會計及資訊專業理論之傳授及實務應用為發展重點。
本系設有日間部、進修部及進修學校（院）（以上兩單位簡稱進修部），日間部包括五專及四技兩種學制，五專部前三年為高職教育，後兩年則為大專教育。五專部及四技學生教育目標之差異在於，五專部強調會計基礎應用能力之培養，四技部較強調基礎理論之傳授，思考與解決問題能力之培養，及實務應用能力。