本系自民國54年本校創建之始即已設立，初期以五專及二專學制為主，強調商業及會計之基礎訓練。自89年本校改制為技術學院，本系於90學年度開始招收二技及四技學生，92年本系改名為「會計資訊系」（簡稱會資系）後，除會計專業外，更強化會計資訊系統及軟體之操作與應用；104年本校成功改名為科技大學，本系持續以會計與稅務專業理論之傳授，及會計、稽核等資訊系統之實務應用為發展重點。

隨著數位科技的發展與行動裝置的普及，電子商務、人工智慧、物聯網與大數據等技術逐漸成熟，同時自2019年起，在COVID-19持續重大影響與人工智慧(AI)與大數據分析的帶動下，企業更面臨不變身就淘汰的風險，因此急需培養可以運用資訊科技來提高公司治理效率、強化法令遵循與加強風險管理(GRC)之 專業人才。

本系在電腦稽核方面已投入人才培育十餘年，目前每年考取電腦稽核軟體專業證照學生人數約百人，不僅使學生具備有數位稽核能力，也讓本系成為各大企業稽核人才之搖籃。此外，為落實大學社會責任，每年學生至國稅局進行報稅服務，協助納稅人完成申報，不僅將所學專業理論付諸實踐，也奠定本系之專業形象。